More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1793 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  100 
 
 
302 aa  610  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  75.17 
 
 
296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  63.25 
 
 
299 aa  361  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  53.31 
 
 
285 aa  296  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  43.04 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  45.94 
 
 
312 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  44.16 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  43.85 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  43.81 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  42.9 
 
 
302 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  44.68 
 
 
310 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  42.7 
 
 
344 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  45.23 
 
 
310 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  42.02 
 
 
345 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  42.56 
 
 
293 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  37.09 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  38.6 
 
 
323 aa  215  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  40.35 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  38.87 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  64.02 
 
 
469 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  38.25 
 
 
310 aa  209  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  37.32 
 
 
300 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  38.13 
 
 
278 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  36.64 
 
 
296 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  38.43 
 
 
288 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  34.82 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  34.71 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  36.31 
 
 
300 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  34.86 
 
 
294 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  36.49 
 
 
282 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.36 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  34.89 
 
 
290 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  32.12 
 
 
323 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.31 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.83 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  32.39 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  32.45 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  36.26 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  35.9 
 
 
316 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  35.16 
 
 
316 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  35.16 
 
 
316 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  35.16 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.63 
 
 
328 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  35.16 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  35.16 
 
 
316 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  35.16 
 
 
316 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  33.22 
 
 
323 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  28.37 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
314 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  35.34 
 
 
265 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  31.51 
 
 
358 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 
292 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  28 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 
353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 
306 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 
317 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  27.15 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 
332 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  28.72 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  30.79 
 
 
308 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 
301 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.71 
 
 
349 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.21 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  31.97 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  28.46 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.21 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.25 
 
 
298 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.84 
 
 
292 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 
303 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  32.6 
 
 
304 aa  119  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.48 
 
 
320 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.2 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 
324 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  29.73 
 
 
331 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.44 
 
 
340 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  32.21 
 
 
333 aa  113  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>