More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0400 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  53.07 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  49.26 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  47.67 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  49.26 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  44.05 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  47.18 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  44.32 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  41.49 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  49.32 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  41.49 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  47.7 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  45.96 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  42.19 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  42.42 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  42 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  43.77 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  43.12 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  38.99 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  37.54 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  40.54 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  40.91 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  40.83 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  40.07 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.48 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  39.11 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  38.21 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  41.51 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  36.97 
 
 		 292 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  37.96 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.68 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.55 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  31.72 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.69 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  29.78 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  35.79 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  43.23 
 
 		 469 aa  142  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  30.58 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.94 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.25 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  31.94 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.25 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  31.25 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  31.25 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  30.1 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.9 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.9 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  32.95 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.53 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 304 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.19 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  29.69 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  29.3 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.9 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.28 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.46 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.46 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.71 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.24 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.3 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.36 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  33.59 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  23.26 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.52 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.66 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  27.41 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  29.07 
 
 		 506 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  29.96 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  22.89 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>