More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2836 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  54.05 
 
 		 292 aa  318  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  54.61 
 
 		 298 aa  315  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  38.79 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  36.86 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  34.15 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  34.97 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  32.85 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  32.29 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  30.66 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.36 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.56 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.14 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  31.1 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  25.51 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  24.27 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  29.74 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 		 371 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  26.98 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.72 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.04 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  27.1 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.86 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  24.56 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.32 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  27.14 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  29.23 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  28.57 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  28.57 
 
 		 322 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.76 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.77 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  24.21 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  24.21 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.79 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.79 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.11 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.86 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.86 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.86 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  27.6 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  30.22 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.11 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.5 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  29.27 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  28.78 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.5 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.5 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.6 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>