More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1011 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 357 aa  716    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  35.62 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  33.24 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  34.15 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  34.92 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.93 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.51 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.51 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.51 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.2 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.2 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.84 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  36.26 
 
 		 463 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.53 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.83 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.53 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  32.22 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.48 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  25.85 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  35.39 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.29 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  25.51 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  29.82 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.07 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  23.6 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  23.67 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.93 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.55 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  23.69 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  23.69 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 333 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  22.52 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  22.52 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 		 309 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  24 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  27.58 
 
 		 312 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  26.13 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  25.18 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.12 
 
 		 320 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  24.67 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.94 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.53 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.41 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  25.3 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  21.35 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  26.79 
 
 		 287 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 		 292 aa  89.7  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  23.81 
 
 		 299 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.07 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  22.1 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  30.66 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 345 aa  89.4  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  24.01 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  27.5 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.39 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  23.61 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 		 308 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  24.22 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  25.46 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  23.13 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  26.98 
 
 		 308 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  23.13 
 
 		 322 aa  86.3  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  24.56 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>