More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0851 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 337 aa  672    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  48.88 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  48.82 
 
 		 462 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  53.01 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  37.09 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  33.24 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  30.75 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.06 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.28 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.05 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.98 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.32 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  30.51 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.96 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.96 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.96 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  23.51 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  27.07 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  29.45 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  24.23 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.22 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.27 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.63 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  27.91 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.37 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.37 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  23.01 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.48 
 
 		 514 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  24.16 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 		 515 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.09 
 
 		 515 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  23.15 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.72 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 312 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  22.64 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  32.45 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  29.95 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.1 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  31.65 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  30.73 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.1 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  23.97 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  23.42 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.91 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.57 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.56 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  37.04 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  24.5 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  32.74 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.38 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  33.61 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  32.34 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  32.45 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  28.68 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  21.92 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.02 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>