More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1633 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 353 aa  707    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  47.75 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  50.55 
 
 		 462 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  52.75 
 
 		 463 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  33.14 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  28.21 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.84 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.95 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.55 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.25 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.25 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.55 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.25 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.55 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.96 
 
 		 316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.74 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.36 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  27.27 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  27.48 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  24.38 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.37 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.09 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.55 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.55 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.2 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.86 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  35.62 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  22.35 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25.81 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  32.32 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  28.37 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.78 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  30 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  30.65 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  30.51 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  34.03 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  24.55 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  30.92 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  29.12 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  29.61 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  24.79 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  24.1 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  32.64 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0500  periplasmic solute binding protein  26.26 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000159961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.07 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.07 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  22.91 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  32.06 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.34 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  22.4 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  30.71 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  33.6 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.65 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  37.04 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.58 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  23.46 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.52 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  32.64 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  24.31 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.31 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.31 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.45 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>