More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2570 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 360 aa  732    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  66.18 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  55.74 
 
 		 350 aa  339  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  36.09 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.52 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  33.72 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  27.65 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 463 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.75 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.33 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  25.43 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.5 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  25.5 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.42 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.42 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.42 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.83 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.75 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.16 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  32.79 
 
 		 462 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 321 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  25.8 
 
 		 317 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  25.8 
 
 		 317 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  25.69 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 		 316 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  26.3 
 
 		 298 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 304 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.3 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  24.35 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  23.33 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  30.46 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  24.51 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  28.2 
 
 		 311 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  26.87 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  27.13 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.97 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  26.98 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  26.45 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  26.98 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  24.31 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  23.73 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.97 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  23.41 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  23.89 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  24.22 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  23.36 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  26.64 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  23.87 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  25.55 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  23.65 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.87 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  22.71 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  29.91 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  24.73 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  24.32 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.35 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  25.8 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.99 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  28.44 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  26.18 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0696  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.39 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  23.81 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  26.83 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.16 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  29.02 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  24.28 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  18.73 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  20.72 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.36 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  22.11 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>