More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0696 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0696  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  28.81 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.87 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.38 
 
 		 288 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  29.73 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  26.6 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.34 
 
 		 345 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.2 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.24 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  25.71 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.49 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.83 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  23.81 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.22 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  27.13 
 
 		 302 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  24.91 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.95 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.25 
 
 		 349 aa  95.9  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  26.22 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.3 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.01 
 
 		 317 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.01 
 
 		 317 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.07 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.95 
 
 		 316 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 469 aa  92.4  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  26.95 
 
 		 316 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  26.95 
 
 		 316 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  27.83 
 
 		 346 aa  92.4  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.64 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  29.72 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  24.81 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.85 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  24.28 
 
 		 324 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  22.71 
 
 		 515 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  22.71 
 
 		 515 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  24.06 
 
 		 300 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.24 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  32.82 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.26 
 
 		 316 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.86 
 
 		 316 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  23.17 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.85 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  27.78 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.48 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  22.35 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  25 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  25.57 
 
 		 337 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  24 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  24.15 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  22.3 
 
 		 345 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.54 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  22.87 
 
 		 332 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 320 aa  85.9  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.36 
 
 		 514 aa  85.5  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  22.91 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  24.41 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  21.17 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  21.17 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  22.69 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.13 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  26.23 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>