More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1191 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 350 aa  703    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  53.75 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  53.37 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  35.28 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.15 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  31.55 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.08 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.72 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.72 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29.45 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.39 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.72 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.06 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.39 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  27.84 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  33.51 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  36.13 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.13 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.02 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.12 
 
 		 514 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.45 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  28.64 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.4 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  26.79 
 
 		 265 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  30.73 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.53 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.18 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  26.88 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  24.81 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  30.17 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  29.15 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  24.81 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  35.08 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  33.8 
 
 		 300 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.89 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  27.66 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.85 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.08 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 287 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 346 aa  85.9  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  28.32 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.52 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  21.23 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.85 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.11 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.46 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.68 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  35.75 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  34.95 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.82 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  28.77 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  27.4 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  22.58 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.24 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  28.88 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  24.81 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.23 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  24.89 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  28.17 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  33.5 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  28.91 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  29.87 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>