More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3480 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 462 aa  921    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  52.35 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  50.55 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  51.1 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  39.57 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  35.39 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  33.51 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  32.79 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 307 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.07 
 
 		 314 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  32.96 
 
 		 309 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 311 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  29.83 
 
 		 318 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  33.16 
 
 		 313 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  34.24 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  35.08 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  41.98 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  35.11 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  33.05 
 
 		 322 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  26.82 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  33.59 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  28.33 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.18 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3481  aspartic acid-rich protein  39.09 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  33.88 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  32.05 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.46 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.27 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  27.89 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  33.33 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  27.47 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 344 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 309 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  31.98 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.35 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.35 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.61 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.67 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  28.49 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  31.67 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  32.5 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  31.67 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  34.45 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  25.53 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  28.73 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  33.62 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.25 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  35.77 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  30.71 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.25 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  36.8 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  29.28 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.37 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  25.43 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.58 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>