More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0963 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
320 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  34.21 
 
 
360 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 
337 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  31 
 
 
362 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.09 
 
 
314 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  37.57 
 
 
463 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  39.57 
 
 
462 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 
316 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.76 
 
 
317 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.76 
 
 
317 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.9 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.54 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.08 
 
 
316 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.75 
 
 
316 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.08 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.08 
 
 
316 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.08 
 
 
316 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
316 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.08 
 
 
316 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  24.69 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.31 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  27.9 
 
 
311 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.39 
 
 
514 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 
287 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 
301 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 
333 aa  109  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 
314 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.43 
 
 
320 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.2 
 
 
311 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.16 
 
 
349 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.69 
 
 
298 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.3 
 
 
296 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  26.69 
 
 
298 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 
332 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
311 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27 
 
 
315 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  24.89 
 
 
265 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  27.64 
 
 
306 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  28.4 
 
 
304 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 
333 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  25.63 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  24.21 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  28 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  26.78 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
304 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.66 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  24.89 
 
 
311 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  25.09 
 
 
315 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  22.77 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  25.58 
 
 
331 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.74 
 
 
290 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  27.7 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.05 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.17 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  21.79 
 
 
506 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  22.49 
 
 
311 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.71 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  22.49 
 
 
311 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  23.65 
 
 
365 aa  87  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  25.91 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  22.83 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  24.33 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.46 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  25.97 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  23.36 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  21.49 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  21.71 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  22.92 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.94 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  24.78 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  24.05 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.51 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  23.84 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25.45 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  21.69 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  23.28 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  20.18 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>