254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11341 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 387 aa  781    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  71.13 
 
 		 513 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  69.59 
 
 		 516 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  68.56 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  63.73 
 
 		 509 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  64.1 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  62.89 
 
 		 515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  32.99 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  24.26 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  28.72 
 
 		 305 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  24.53 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  24.01 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  23.43 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  23.71 
 
 		 335 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.64 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.5 
 
 		 344 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  29.83 
 
 		 313 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  26.11 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  28.65 
 
 		 313 aa  86.7  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  23.17 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  27.81 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.06 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.04 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  25.27 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  25.15 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  21.56 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  24.2 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  23.93 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  21.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  29.56 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  21.1 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  28.29 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  21.43 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  23.78 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.29 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  23.86 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  22.66 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.89 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  24.32 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  21.14 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.93 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  27.32 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  23.67 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.07 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.35 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.85 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  26.26 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  23.16 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  23.81 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  27.61 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.12 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  21.8 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  29.41 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  22.7 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  25.54 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  22.46 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.62 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.79 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  19.81 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  27.37 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  28.48 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  20.96 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4723  periplasmic solute binding protein  21.2 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4809  periplasmic solute binding protein  21.2 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5108  periplasmic solute binding protein  21.2 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829709  normal  0.108422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  23.08 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  28.86 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  22.58 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  24.5 
 
 		 532 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>