More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2033 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2620  periplasmic solute binding protein  86.07 
 
 		 532 aa  928    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2033  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 532 aa  1082    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.395219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  55.51 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  54.87 
 
 		 514 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  48.04 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  35.96 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  41.71 
 
 		 313 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  40.82 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  41.52 
 
 		 310 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  41.48 
 
 		 301 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  37.57 
 
 		 294 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  39.68 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  38.62 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  36.26 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  34.46 
 
 		 317 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  41.42 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  35.03 
 
 		 326 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  33.5 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 302 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  39.67 
 
 		 309 aa  113  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  40.22 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  38.42 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  35.59 
 
 		 320 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.49 
 
 		 344 aa  110  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.67 
 
 		 315 aa  110  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  38.67 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 		 327 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  36.72 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  36.11 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.37 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 298 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 		 303 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 		 328 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  30.06 
 
 		 299 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 319 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 371 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.02 
 
 		 298 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 292 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.11 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  40.11 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  34.09 
 
 		 291 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  40.34 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  29.74 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  29.74 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.74 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.8 
 
 		 312 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  31.63 
 
 		 321 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  32.6 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 347 aa  99.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  33.52 
 
 		 315 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  32.61 
 
 		 321 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  30.73 
 
 		 303 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  34.04 
 
 		 335 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.17 
 
 		 291 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 305 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 		 321 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 346 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 304 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.06 
 
 		 298 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  32.93 
 
 		 345 aa  95.9  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  36.44 
 
 		 292 aa  95.1  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 		 292 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  35.39 
 
 		 307 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 304 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 354 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 299 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  34.92 
 
 		 292 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  36 
 
 		 314 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  31.74 
 
 		 313 aa  94.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  36.46 
 
 		 309 aa  94.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  29.35 
 
 		 308 aa  94  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.41 
 
 		 303 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.96 
 
 		 286 aa  93.2  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  32.07 
 
 		 346 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  32.24 
 
 		 310 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  39.55 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  27.71 
 
 		 311 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  27.71 
 
 		 322 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  28.25 
 
 		 341 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 292 aa  91.3  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  28.49 
 
 		 313 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  27.71 
 
 		 322 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  36.44 
 
 		 292 aa  91.3  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 309 aa  90.9  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.15 
 
 		 331 aa  90.9  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  90.5  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  33.15 
 
 		 301 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  31.25 
 
 		 287 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  28.88 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>