243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11261 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  77.8 
 
 		 516 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 506 aa  1032    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  77.67 
 
 		 513 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  62.45 
 
 		 515 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  64.24 
 
 		 509 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  66.86 
 
 		 371 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11341  ABC transporter substrate-binding protein  69.23 
 
 		 387 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29281  ABC transporter substrate-binding protein  31.4 
 
 		 326 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  30.69 
 
 		 308 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1364  ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  34.59 
 
 		 326 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  35.52 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 326 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 335 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  25.95 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.05 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.09 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 319 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 		 494 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 325 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  35.56 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  26.82 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  25.69 
 
 		 346 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  25.68 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  23.27 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  33.33 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  33.33 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  20.79 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  23.56 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.04 
 
 		 312 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  25.12 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  21.62 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  23.9 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  24.1 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  22.5 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.36 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  23.62 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  24.06 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  21.43 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  23.6 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07770  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.94 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  22.36 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  22.35 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  23.49 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.39 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  24.86 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0845  periplasmic solute binding family protein  23.68 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  23.7 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.17 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  22.6 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  23.37 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  22.03 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.13 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  22.63 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0338  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.24 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.166194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  24.06 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  21.43 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  23.63 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  23.91 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  23.6 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  19.46 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  24.34 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1238  anchored repeat ABC transporter, substrate-binding protein  26.87 
 
 		 571 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000243739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  23.63 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  22.36 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  23.89 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.38 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  21.88 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  23.68 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  24.85 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.32 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  25.16 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  21.08 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  21.71 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  21.94 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  22.6 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  18.64 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  22.61 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>