35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25431 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  100 
 
 
477 aa  977    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  78.82 
 
 
472 aa  709    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  100 
 
 
477 aa  977    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  42.39 
 
 
391 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1035  ABC-type metal ion transport system periplasmic component  34.53 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19051  ABC transporter substrate-binding protein  35.07 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  33.57 
 
 
513 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1043  ABC transporter substrate-binding protein  32.86 
 
 
516 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.34335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11261  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.319641  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15221  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.508004  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  32.64 
 
 
251 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  30.57 
 
 
261 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  29.53 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  28.92 
 
 
255 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  27.88 
 
 
305 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  28.82 
 
 
291 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  30.17 
 
 
289 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  32.74 
 
 
263 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  32.64 
 
 
242 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  31.94 
 
 
244 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  27.14 
 
 
231 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  31.67 
 
 
257 aa  55.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  27.83 
 
 
265 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  36.21 
 
 
246 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  22.22 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  27.22 
 
 
268 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  30.83 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25.15 
 
 
424 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  31.01 
 
 
258 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  26.87 
 
 
268 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  26.12 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  31.86 
 
 
229 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  26.85 
 
 
388 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  31.08 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  31.08 
 
 
336 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>