140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1765 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  100 
 
 		 261 aa  500  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  60.94 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  56.65 
 
 		 265 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  59.3 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  47.11 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  43.89 
 
 		 291 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  44.91 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  45.2 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  44.44 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  44.15 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  43.97 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  44.62 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  40.66 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  43.97 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  46.33 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  38.55 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  36.64 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  35.84 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  38.89 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  38.89 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  40.34 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  36.52 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  38.29 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  34.57 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  43.36 
 
 		 301 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  36.24 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  34.56 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  31.11 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  48.45 
 
 		 115 aa  95.9  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  35.16 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  39.86 
 
 		 391 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  36.84 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25.67 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  27.54 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  29.51 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29.15 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  27.35 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  26.34 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  32.22 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  25.68 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  48.61 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  40.79 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  27.73 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  26.56 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  27.18 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  27.18 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  28.26 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  26.52 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  26.21 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  27.91 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  38.4 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  29.21 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  29.21 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  21.37 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  26.63 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.14 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3935  zinc/iron permease  28.97 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  25.38 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  26.22 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  29.54 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  29.54 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  26.58 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  25.91 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  23.74 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  27.15 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  26.24 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  22.28 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  29.45 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  25.45 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  27.65 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  28.38 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  27.51 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  28.67 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  26.29 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  27.71 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.06 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.06 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  27.17 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  25.38 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.04 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  21.61 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  26.02 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  27.27 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  27.19 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  29.86 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  32.46 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  26.38 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  25.93 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  32.26 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  30 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  24.47 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  23.92 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  28.27 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  29.8 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  26.76 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>