84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3460 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  100 
 
 		 246 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  51.68 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  49.79 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  47.62 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  53.06 
 
 		 373 aa  151  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  39.29 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  35.1 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  30.98 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  31.56 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  30.68 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  30.42 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  30 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  35.43 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  34.87 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  32.48 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  30.98 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  35.62 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  32.44 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  45.45 
 
 		 391 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  29.78 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  28.49 
 
 		 424 aa  79  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  28.83 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  29.17 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  33.09 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  26.48 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  33.09 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  27.98 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  27.15 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  31.03 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  28.17 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  34.78 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  28.87 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  30.21 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  31.3 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  48.65 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  48.65 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  33.6 
 
 		 472 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  36.21 
 
 		 477 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  36.21 
 
 		 477 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  26.1 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  28.16 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  26.61 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  28.9 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  34.83 
 
 		 115 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  25.58 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  28.46 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  31.29 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  31.4 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  32.48 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  33.02 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  34.19 
 
 		 298 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  27.41 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  24.11 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  25.84 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  24.11 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  23 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  25.67 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  33.04 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  30.53 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  29.32 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  26.03 
 
 		 237 aa  42  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  29.2 
 
 		 265 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  30.37 
 
 		 265 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1409  zinc/iron permease  23.84 
 
 		 244 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  26.55 
 
 		 239 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>