111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1472 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  100 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  47.62 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  48.26 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  47.19 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  53.06 
 
 		 373 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  36.32 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  33.6 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  35.32 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  30.8 
 
 		 265 aa  121  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  33.94 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  33.8 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  29.92 
 
 		 271 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  33.1 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  33.1 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  34.95 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  39.55 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  31.11 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  39.55 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  36.43 
 
 		 289 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  30.65 
 
 		 298 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  30.99 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  30.99 
 
 		 291 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  28.11 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  29.29 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  27.37 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  32.64 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  27.56 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  25 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  28.48 
 
 		 424 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  35.17 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  27.27 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  27.27 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  28.21 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  29.71 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  26.96 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.15 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  27.82 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  25.65 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  27.14 
 
 		 477 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  27.14 
 
 		 477 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.96 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  30.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  24.77 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  32.29 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  25.35 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  25.12 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  26.43 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  25.86 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  28.41 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  28.24 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  45.21 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  45.21 
 
 		 335 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  25.57 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.43 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.27 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.51 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  26.86 
 
 		 472 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  28.89 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  29.41 
 
 		 388 aa  53.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  27.88 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  26.39 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  28.27 
 
 		 305 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  28.27 
 
 		 308 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.33 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  25.93 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  40.23 
 
 		 104 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  26.94 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  26.94 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.24 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.13 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  27.44 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.13 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  32.52 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  27.75 
 
 		 298 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  30.37 
 
 		 312 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  27.27 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  23.48 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25.11 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  24.77 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  24.45 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  29.63 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  35.04 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  23.85 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3478  zinc/iron permease  34.96 
 
 		 411 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  22.46 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>