17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0974 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  49.51 
 
 		 255 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  47.57 
 
 		 265 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  47.57 
 
 		 258 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  47.56 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.21 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  40.62 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  37.11 
 
 		 373 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  48.61 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  42.71 
 
 		 298 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  38.46 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  45.45 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  40.23 
 
 		 231 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  34.95 
 
 		 246 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  39.36 
 
 		 242 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  39.18 
 
 		 244 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  32.63 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>