77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4980 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  100 
 
 
242 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  85.42 
 
 
244 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  49.79 
 
 
246 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  48.26 
 
 
231 aa  214  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  52.45 
 
 
373 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  40.17 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  41.33 
 
 
229 aa  141  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  33.07 
 
 
265 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  41.8 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  37.24 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  35.06 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  34.63 
 
 
268 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  36.84 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  37.37 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  34.2 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  35 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  35.45 
 
 
257 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  32.55 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  32.16 
 
 
305 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  35.32 
 
 
289 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  31 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  27.16 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  27.86 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  27.4 
 
 
316 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.87 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  26.13 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  31.94 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  31.94 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  31.43 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  29.3 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  34.31 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  36.96 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  27.46 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.52 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.25 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  28.76 
 
 
472 aa  62.4  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  30.11 
 
 
243 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  36 
 
 
336 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  36 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  30.34 
 
 
391 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  24.3 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  26.61 
 
 
477 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  26.61 
 
 
477 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  40.58 
 
 
115 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  26.32 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  27.49 
 
 
289 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3935  zinc/iron permease  26.8 
 
 
288 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  24.51 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  27.04 
 
 
269 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  27.66 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  41.89 
 
 
104 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  27.54 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3849  zinc/iron permease  26.48 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  30.23 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  26.12 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.83 
 
 
277 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  27.71 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  25.33 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  26.61 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  28.28 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.67 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  26.8 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  24.76 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  25.82 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  32.69 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  26.28 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.75 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  25.11 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  25.64 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  25 
 
 
308 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  31.36 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  26.27 
 
 
276 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.06 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  24.59 
 
 
257 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  24.59 
 
 
257 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  24.59 
 
 
257 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  24.59 
 
 
257 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>