74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2667 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  100 
 
 
276 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  98.91 
 
 
276 aa  523  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  70.67 
 
 
316 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  66.67 
 
 
298 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  70.76 
 
 
277 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  67.27 
 
 
271 aa  315  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  68.46 
 
 
275 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  68.25 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  51.5 
 
 
260 aa  208  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  48.19 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  39.48 
 
 
255 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  37.22 
 
 
265 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  41.03 
 
 
305 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  40.36 
 
 
291 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  36.9 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  43.48 
 
 
261 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.74 
 
 
263 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  38.71 
 
 
268 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  39.43 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  38.71 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  39.7 
 
 
257 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  34.72 
 
 
251 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  38.95 
 
 
257 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  34.8 
 
 
229 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  30.6 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  32.46 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  28.76 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  30.57 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  42.71 
 
 
115 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.57 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25.08 
 
 
424 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  26.51 
 
 
391 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  30.7 
 
 
373 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.89 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.66 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  21.38 
 
 
272 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.2 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  24.03 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  24.03 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  29.07 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  21.68 
 
 
388 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  25.87 
 
 
391 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  23.58 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  46.55 
 
 
104 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.3 
 
 
277 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  23.67 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.98 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.69 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.24 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  23.77 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  24.28 
 
 
291 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  23.85 
 
 
266 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  23.08 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  24.58 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  24.58 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  23.85 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  46.43 
 
 
335 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  46.43 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  20.93 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  23.47 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  24.54 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  23.44 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  30.09 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  23.44 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  23.44 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  23.44 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.14 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.32 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  24.43 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  21.22 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  23.4 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  23.53 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  24.3 
 
 
261 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.5 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>