36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42479 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  100 
 
 		 391 aa  784    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  28.65 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  28.91 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  27.17 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  34.03 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  27.11 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  25.6 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  30.16 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  26.32 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  29.26 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  29.26 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  28.26 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  24.41 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  26.77 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  31.46 
 
 		 244 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  26.7 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  29.12 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  25.39 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  26.7 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  25.27 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  25.27 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  30.34 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  24.81 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  26.18 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  21.5 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  23.97 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  24.5 
 
 		 301 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  33.64 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  33.64 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  24.49 
 
 		 477 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  24.49 
 
 		 477 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  22.88 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  25.54 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  30.39 
 
 		 115 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  22.41 
 
 		 277 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>