65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2879 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  100 
 
 
298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  65.77 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  66.09 
 
 
277 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  62.37 
 
 
271 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  65.98 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  65.64 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  61.86 
 
 
275 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  64.95 
 
 
301 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  51.38 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  45.21 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  35.61 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  34.95 
 
 
258 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  38.08 
 
 
263 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  36.17 
 
 
255 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  36.17 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  33.21 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  36.17 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  38.33 
 
 
257 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  37.63 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  36.01 
 
 
268 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  36.01 
 
 
268 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  36.01 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  36.48 
 
 
261 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  31.17 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  30.65 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  25.33 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  42 
 
 
115 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  29.61 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  24.79 
 
 
244 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  27.15 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25.34 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  30.5 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  25.9 
 
 
391 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  24.89 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.32 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.66 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.66 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00350  low-affinity zinc ion transporter, putative  29.75 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  24.64 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  26.95 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  48.28 
 
 
104 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.41 
 
 
244 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  25.86 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  23.66 
 
 
239 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  26.32 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  22.12 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.71 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  27.04 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  24.69 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  23.38 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  27.67 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  23.23 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  45.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  22.37 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  24.8 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  24.34 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  26.36 
 
 
477 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  26.36 
 
 
477 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  36.73 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  22.52 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.52 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  24.81 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  24.83 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  24.83 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.57 
 
 
246 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>