174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1139 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  40.34 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  43.75 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  37.39 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  43.58 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  34.7 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  35.29 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  32.37 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  33.04 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  30.51 
 
 		 272 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  29.8 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  35.75 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  35.25 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  31.54 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  31.25 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.74 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  33.74 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.8 
 
 		 277 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  33.79 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  34.43 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  33.79 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  31.33 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  32.73 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  28.16 
 
 		 267 aa  92  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  36.06 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  34.08 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  31.62 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  34.34 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  29.74 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  27.92 
 
 		 271 aa  89.4  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  31.11 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  31.58 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  29.24 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  31.11 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  30.71 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  28.81 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  28.81 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  29.63 
 
 		 269 aa  88.6  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  29.1 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  30.96 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  28.95 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  30.7 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  29.51 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  31.8 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  30.21 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  30.09 
 
 		 273 aa  85.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  32.47 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  29.25 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  30 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  29.13 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.57 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.88 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  33.64 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  27.36 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  29.04 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  29.78 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  29.51 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.73 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  33.68 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  25.94 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  31.34 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  27.75 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2098  zinc/iron permease  45.69 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  31.95 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  26.75 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  27.1 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  30.97 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  32.3 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  28.02 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  28.97 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  26.17 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  29.11 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  34.96 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  30.39 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.26 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  25.36 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  24.19 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  32.47 
 
 		 390 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  27.13 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  29.07 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  28.05 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  28.09 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  28.76 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  29.39 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>