153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1427 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  90.66 
 
 		 257 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  66.02 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  65.23 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  65.23 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  63.24 
 
 		 305 aa  254  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  61.66 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  62 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  44.36 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  46.75 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  44.53 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  44.09 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  42.37 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  45 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  39.3 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  38.32 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  38.75 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  35.89 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  38.66 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  37.41 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  39.48 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  38.38 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  38.38 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  39.86 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  37.57 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  36.2 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  36.59 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  50 
 
 		 115 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  33.18 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  40.71 
 
 		 373 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  27.59 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.89 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  30.47 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  36.81 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.33 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.33 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.79 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.18 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.58 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  27.18 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  27.18 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  27.18 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  27.18 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  27.18 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.37 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  24.85 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  28.35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.79 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  26.92 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  44.19 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  44.19 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  26.14 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  29.31 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  29.31 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  36.67 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.71 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  22.92 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  24.55 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.06 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  27.41 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  24.79 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  24.16 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  24.02 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  25.21 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  23.58 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  21.5 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  29.58 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  29.25 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  26.27 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  52.38 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  26.54 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  27.08 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  25.81 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  31.54 
 
 		 477 aa  55.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  31.54 
 
 		 477 aa  55.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.9 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  31.67 
 
 		 472 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  27.22 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  22.79 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  23 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3792  zinc/iron transporter  30.25 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  25.57 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  20.19 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  30.16 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  21.15 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  20.61 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.13 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  24.12 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3849  zinc/iron permease  31.09 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  29.03 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  21.21 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>