167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3472 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  100 
 
 		 253 aa  490  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  97.67 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  90.66 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  90.66 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  90.66 
 
 		 257 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  90.66 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  90.66 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  87.94 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  81.71 
 
 		 255 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  39.5 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  39.64 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  39.53 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  35.5 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  37.6 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  37.41 
 
 		 281 aa  158  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  39.69 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  39.36 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  35.98 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  39.46 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  38.46 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  39.04 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  36.95 
 
 		 267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  34.02 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  38.55 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  33.46 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  37.02 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  35.98 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  40.38 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  34.98 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  36.27 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  33.2 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  39.83 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  31.19 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  42.95 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  34.55 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  45.32 
 
 		 188 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  31.6 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  30.68 
 
 		 251 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  31.42 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  34.8 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  31.84 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  31.05 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  31.08 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  32.79 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  34.36 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  32.96 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  32.68 
 
 		 300 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.89 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  30.68 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  30.08 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.15 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  30.89 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  31.67 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  31.08 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  31.67 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  30.52 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  28.4 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  32.38 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  34.15 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  29.2 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  27.78 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  30.13 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  30.28 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  29.69 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  29.84 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  29.15 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  29.96 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  31.45 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  30.83 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  30.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  28.96 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  33.07 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.69 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.71 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.71 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  31.45 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  34.31 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  31.66 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  33.89 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  30.98 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  29.75 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  33.18 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  33.89 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  30.49 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  33.47 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  32.23 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  28.46 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  34.31 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  32.93 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  30.99 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>