144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0947 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  100 
 
 		 302 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  99.66 
 
 		 297 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  96.3 
 
 		 297 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  94.28 
 
 		 297 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  76.69 
 
 		 297 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  58.42 
 
 		 300 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  60.69 
 
 		 310 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  47.35 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  50.85 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  45.72 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  50.21 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  43.36 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  42.66 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  40.74 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  45.02 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  47.41 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  45.49 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  43.43 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  44.22 
 
 		 250 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  44.22 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  44.22 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  36.54 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  44.17 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  44.17 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  42.57 
 
 		 255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  39.84 
 
 		 261 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  44 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  43.48 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  36.89 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  41.39 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  36.09 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  39.41 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  38.11 
 
 		 246 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  36.86 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  42.48 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  35.27 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  38.71 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  36.95 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  39.37 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  37.19 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  35.48 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  35 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  36.72 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  34.66 
 
 		 243 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  37.23 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  37.81 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  38.46 
 
 		 273 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  35.55 
 
 		 269 aa  132  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  37.6 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  35.89 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  38.89 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  35.71 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.16 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  40.67 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  36.57 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  33.21 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  34.24 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  35.74 
 
 		 270 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  37.71 
 
 		 258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  36.51 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  37.08 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  36.23 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  31.79 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  32.86 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  33.46 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  30.58 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  32.06 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  32.24 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  28.46 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  34.7 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  36.13 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  32.59 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  29.41 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  28.87 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  40.5 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.56 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  31.65 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  27.92 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.99 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  29.17 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  28.57 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  36.09 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  31.54 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  33.08 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  26.89 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  35.14 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  25.56 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  26.38 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  34.59 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  29.49 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  29.49 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  29.49 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  29.49 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  29.49 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>