148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0852 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  100 
 
 		 297 aa  564  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  77.03 
 
 		 297 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  77.36 
 
 		 297 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  76.69 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  74.32 
 
 		 297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  60.2 
 
 		 300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  60.94 
 
 		 310 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  49.13 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  53.28 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  51.43 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  50 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  48.56 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  48.56 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  41.28 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  43.16 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  45.95 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  46.3 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  46.72 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  48.41 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  47.39 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  44.8 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  45.2 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  44.8 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  44.8 
 
 		 312 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  40.59 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  46.38 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  44.13 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  44.76 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  39.5 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  42.86 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  41.09 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  40.64 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  37.08 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  40.86 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  39.92 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 271 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  37.5 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  42 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  37.89 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  40.4 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  41.91 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  38.28 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  41.06 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  43.78 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  38.91 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  39.52 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  39.52 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  39.34 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  39.04 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  39.26 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  38.33 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  38.19 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.94 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  36.96 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  38.31 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  37.94 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  41.2 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.68 
 
 		 264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  35.96 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  36.3 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  34.26 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  39.15 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  39.05 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  38.74 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  36.05 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  31.85 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  30.22 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  34.84 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  29.48 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  32.52 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  33.46 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  33.64 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  29.53 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  31.97 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  32.1 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  29.71 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  29.22 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.13 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  32.59 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  32.68 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  29.28 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  31.39 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  28.33 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  31.02 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  28.67 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  28.79 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  33.03 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.5 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  32.11 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  32.11 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  32.11 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  32.11 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  36.23 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>