173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  100 
 
 
317 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  70.59 
 
 
312 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  72.08 
 
 
308 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  71.81 
 
 
305 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  69.55 
 
 
312 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  69.61 
 
 
312 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  76.4 
 
 
250 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  62.14 
 
 
309 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  58.73 
 
 
305 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  54.78 
 
 
300 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  50.68 
 
 
300 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  58.47 
 
 
306 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  47.5 
 
 
304 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  47.08 
 
 
309 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  47.92 
 
 
260 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  47.92 
 
 
260 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  43.86 
 
 
261 aa  199  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  45.83 
 
 
297 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  46.97 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  46.59 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  45.08 
 
 
297 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  51.5 
 
 
300 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  47.52 
 
 
279 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  43.39 
 
 
261 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  42.15 
 
 
255 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  49.6 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  46.64 
 
 
258 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  48.84 
 
 
310 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  43.87 
 
 
278 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  42.02 
 
 
245 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  42.02 
 
 
245 aa  168  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  44.78 
 
 
297 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  42.25 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  43.98 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  40.74 
 
 
246 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  41.11 
 
 
271 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  40.39 
 
 
246 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  38.19 
 
 
264 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  36.48 
 
 
251 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  42.59 
 
 
271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  39.07 
 
 
273 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  41.48 
 
 
271 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  37.5 
 
 
272 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  38.25 
 
 
258 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  38.02 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  36.65 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  36.25 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  38.43 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  36.36 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  38.65 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  38.35 
 
 
270 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  38.55 
 
 
272 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  38.7 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.77 
 
 
264 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  39.02 
 
 
270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  34.87 
 
 
268 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  39.3 
 
 
270 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  42.15 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  34.87 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  39.17 
 
 
258 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  39.84 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  39.85 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  37.7 
 
 
277 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  34.6 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.46 
 
 
244 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.54 
 
 
244 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  34.16 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  33.21 
 
 
286 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  36.4 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  39.43 
 
 
254 aa  113  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  37.13 
 
 
247 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  32.77 
 
 
258 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  34.29 
 
 
266 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  33.19 
 
 
252 aa  99.4  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  31.87 
 
 
272 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  31.05 
 
 
265 aa  92.4  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  36.18 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  33.98 
 
 
269 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  32.79 
 
 
266 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  32.91 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  31.75 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  32.39 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  34.48 
 
 
247 aa  86.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.55 
 
 
268 aa  85.9  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.56 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49400  predicted protein  31.7 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.396172  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  30.21 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  32.39 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  30.89 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  34.02 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.83 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  30.4 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  28.86 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  29.66 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  32.59 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  34.12 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  31.14 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  32.43 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  28.87 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  34.44 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>