185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1152 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  100 
 
 		 266 aa  527  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  87.12 
 
 		 267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  73.96 
 
 		 266 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  56.46 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  57.58 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  58.4 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  51.67 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  50.51 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  49.83 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  50 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  48.28 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  51.99 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  51.75 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  47.67 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  49.08 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  46.98 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  46.98 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  47.86 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  48.7 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  46.42 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  42.8 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  38.67 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  40.25 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  36.67 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  39.68 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  38.21 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  40.67 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  38.76 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  39.53 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  38.76 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  38.76 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  38.76 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  38.76 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  48.39 
 
 		 390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  33.33 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  36.55 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  37.33 
 
 		 188 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  30.97 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  32.26 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  35.27 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  32.51 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  35.66 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  28.96 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  35.27 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  34.1 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  31.7 
 
 		 304 aa  99  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  32.45 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  30.9 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  31.82 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  35.12 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  31.52 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.92 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  32.2 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  33.07 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  33.07 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  29.27 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  30.57 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  32.66 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  31.82 
 
 		 312 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  31.32 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  30.26 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  30.92 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  27.43 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  33.46 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  32.2 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  29.72 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  29.15 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  29.28 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  32.28 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  29 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  33.07 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  33.07 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  33.78 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  31 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  33.07 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  31.56 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  33.2 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  32.81 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29.49 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  30.2 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  32.43 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  31.5 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  31.64 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  27.02 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  44 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  29.96 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  29.77 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  30.2 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  29.55 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>