167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1916 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  100 
 
 
270 aa  524  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  65.68 
 
 
271 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  66.05 
 
 
271 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  64.81 
 
 
270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  63.1 
 
 
271 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  75.76 
 
 
267 aa  329  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  65.41 
 
 
271 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  65.04 
 
 
273 aa  316  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  59.62 
 
 
269 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  58.11 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  57.09 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  62.59 
 
 
270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  65.79 
 
 
270 aa  301  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  56.99 
 
 
271 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  58.49 
 
 
269 aa  298  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  55.97 
 
 
269 aa  297  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  61.51 
 
 
272 aa  294  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  56.77 
 
 
277 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  55.28 
 
 
258 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  53.85 
 
 
262 aa  251  7e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  50.94 
 
 
268 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  50.94 
 
 
273 aa  232  5e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  49.44 
 
 
276 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  46.77 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  52.14 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  44.74 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  44.74 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  44.69 
 
 
278 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  43.21 
 
 
285 aa  188  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  41.57 
 
 
261 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  43.84 
 
 
300 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  45 
 
 
284 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  39.84 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  45.6 
 
 
245 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  41.77 
 
 
255 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  45.6 
 
 
245 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  42.4 
 
 
246 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  43.66 
 
 
300 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  44.98 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  42.98 
 
 
300 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  41.39 
 
 
297 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  41.16 
 
 
297 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  40.23 
 
 
279 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  41.13 
 
 
259 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  41.39 
 
 
302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  41.92 
 
 
304 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  43.18 
 
 
258 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  41.39 
 
 
297 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  43.66 
 
 
310 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  39.54 
 
 
309 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  38.99 
 
 
308 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  39.52 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  39.71 
 
 
305 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  42.42 
 
 
246 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  42.37 
 
 
250 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  42.42 
 
 
312 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  42.42 
 
 
312 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  42.42 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  37.8 
 
 
243 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  40.46 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  39.26 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  36.97 
 
 
290 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  42.86 
 
 
297 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  41.54 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  40.08 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  38.77 
 
 
317 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  34.72 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  37.04 
 
 
258 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  35.71 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  39.43 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  30.74 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  31.69 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  40.51 
 
 
248 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  32.45 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  33.58 
 
 
277 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  32.49 
 
 
265 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  32.42 
 
 
258 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  34.24 
 
 
247 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  30.74 
 
 
271 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.52 
 
 
244 aa  102  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  30.34 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  32.45 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  33.2 
 
 
266 aa  99  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.84 
 
 
247 aa  99  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  32.62 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  31.65 
 
 
239 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  34.36 
 
 
270 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  32.21 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  29.82 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  29.41 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  29.49 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  31.14 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  29.9 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  30.36 
 
 
291 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  31.01 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  30 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  30.55 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  31.23 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.23 
 
 
253 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  30.03 
 
 
300 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>