169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1721 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  100 
 
 
309 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  52 
 
 
304 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  54.47 
 
 
260 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  54.47 
 
 
260 aa  271  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  53.25 
 
 
300 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  50.58 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  50.43 
 
 
300 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  48.41 
 
 
255 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  46.18 
 
 
261 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  44.16 
 
 
305 aa  221  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  51.04 
 
 
306 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  47.98 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  42.62 
 
 
261 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  50.85 
 
 
300 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  46.64 
 
 
245 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  46.64 
 
 
245 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  43.01 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  45.41 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  47.16 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  42.31 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  41.97 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  41.97 
 
 
312 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  47.49 
 
 
300 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  45.95 
 
 
258 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  45 
 
 
250 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  44.21 
 
 
308 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  44.02 
 
 
246 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  44.63 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  47.1 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  40.08 
 
 
272 aa  179  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  42.92 
 
 
251 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  38.38 
 
 
297 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  38.1 
 
 
297 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  39.18 
 
 
302 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  39.18 
 
 
297 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  40.29 
 
 
278 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  39.47 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  36.15 
 
 
271 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  40.98 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  37.13 
 
 
269 aa  159  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  37.55 
 
 
270 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  37.64 
 
 
272 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  43.17 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  38.78 
 
 
271 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  34.62 
 
 
269 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.84 
 
 
264 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  35 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  36.12 
 
 
269 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  39.53 
 
 
270 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  39.54 
 
 
270 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  38.7 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  38.89 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  40.16 
 
 
244 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  38.08 
 
 
271 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  34.6 
 
 
258 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  37.04 
 
 
243 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  40 
 
 
270 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  35.46 
 
 
268 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  40.38 
 
 
284 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  32.06 
 
 
264 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  42 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  33.33 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  35.86 
 
 
258 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  38.2 
 
 
277 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  34.44 
 
 
276 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  38.65 
 
 
247 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  34.6 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  35.6 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  35.16 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  29.64 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.61 
 
 
265 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  29.7 
 
 
267 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  30.08 
 
 
265 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  31.05 
 
 
244 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  26.96 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  29.84 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  33.48 
 
 
247 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  33.59 
 
 
268 aa  92.8  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  31.23 
 
 
269 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  35.5 
 
 
254 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  31.6 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  30.35 
 
 
265 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  33.83 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  31.27 
 
 
271 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  30.38 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  31.01 
 
 
277 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  30.9 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  30.97 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  28.93 
 
 
239 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  30.43 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  31.78 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  33.04 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  31.43 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  27.03 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.82 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  28.69 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  27.08 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  30.09 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  30.81 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  30.97 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>