192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1456 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  87.12 
 
 
266 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  75.09 
 
 
266 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  59.16 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  58.27 
 
 
268 aa  304  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  55.47 
 
 
277 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  52.61 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  50.35 
 
 
289 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  49.32 
 
 
298 aa  255  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  48.48 
 
 
298 aa  255  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  53.05 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  50.92 
 
 
281 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  47.65 
 
 
298 aa  247  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  50.19 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  47.78 
 
 
300 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  47.92 
 
 
265 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  46.59 
 
 
291 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  46.24 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  49.63 
 
 
275 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  46.04 
 
 
269 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  43.56 
 
 
269 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  37.25 
 
 
258 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  38.41 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  39.26 
 
 
265 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  36.99 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  42.11 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  38.28 
 
 
257 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
253 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  37.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  37.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  37.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  37.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  37.11 
 
 
257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  47.47 
 
 
390 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  39.39 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  37.89 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  35.69 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  36.49 
 
 
188 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  34.94 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  31.71 
 
 
251 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  31.54 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  35.56 
 
 
261 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  30.08 
 
 
244 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  34.39 
 
 
255 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  31.89 
 
 
279 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  34.23 
 
 
273 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  33.07 
 
 
245 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  33.07 
 
 
245 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  31.2 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  31.46 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  32.8 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  32.8 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  32.9 
 
 
239 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  30.92 
 
 
239 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  30.43 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  26.05 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  32.7 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  31.09 
 
 
312 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  31.02 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  31.46 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  30.86 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  31.76 
 
 
250 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  33.73 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  31.19 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  32.08 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  28.69 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  35.27 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  30.86 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  32.31 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  27.38 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  28.35 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.02 
 
 
259 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  33.21 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  29.55 
 
 
308 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  29.85 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  28.42 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  28.2 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  33.33 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  32.8 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  29.55 
 
 
305 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  30.77 
 
 
309 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  30.04 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  32.4 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  32.4 
 
 
297 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  30.38 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  29.74 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  29.48 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  27.85 
 
 
271 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  29.96 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  44 
 
 
125 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  36.72 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  28.23 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.94 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>