154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2148 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  100 
 
 
276 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  49.44 
 
 
270 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  50.94 
 
 
267 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  43.66 
 
 
269 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  42.91 
 
 
269 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  45.52 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  43.82 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  43.66 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  42.48 
 
 
272 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  47.19 
 
 
271 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  43.87 
 
 
271 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  42.75 
 
 
271 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  44.78 
 
 
270 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  45.23 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  44.57 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  44.94 
 
 
277 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  40.89 
 
 
271 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  45.86 
 
 
270 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  40 
 
 
258 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  42.49 
 
 
272 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  41.31 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  39.55 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  39.45 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  39.18 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.45 
 
 
264 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  39.11 
 
 
300 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  34.47 
 
 
255 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  37.3 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  37.3 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  35.86 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  35.29 
 
 
246 aa  139  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  36.78 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  34.77 
 
 
278 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  37.04 
 
 
300 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  35.77 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  38.43 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  37.3 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  32.13 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  36.57 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  36.43 
 
 
310 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  34.83 
 
 
245 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  34.83 
 
 
245 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  41.32 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  34.16 
 
 
258 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  36.19 
 
 
305 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  32.69 
 
 
261 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  35.56 
 
 
309 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  36.7 
 
 
312 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  37.69 
 
 
312 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.55 
 
 
279 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  36.7 
 
 
312 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  36.88 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  33.8 
 
 
285 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  35.34 
 
 
306 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  31.66 
 
 
244 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  30 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  38.04 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  34.44 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.06 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  37.25 
 
 
317 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  31.34 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  29.23 
 
 
286 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  34.07 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  30.56 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  34.07 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  33.58 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  34.67 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.19 
 
 
265 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  33.2 
 
 
258 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  31.84 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  32.05 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  31.25 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  34.27 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  32.08 
 
 
267 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  30.7 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  29.54 
 
 
239 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  29.29 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  33.33 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  30.86 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  29 
 
 
239 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  29.01 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  25.7 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  36.21 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  27.76 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  35.38 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  33.75 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  28.46 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  30.08 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  27 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  29.64 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49400  predicted protein  29.81 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.396172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  30.51 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  26.09 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.74 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  27.04 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  28.62 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  26.85 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86026  ZIP family transporter: zinc ion  30.15 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  25.96 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.95 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>