170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0715 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  100 
 
 		 262 aa  507  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  64.34 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  62.78 
 
 		 264 aa  304  8.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  51.82 
 
 		 272 aa  253  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  53.44 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  52.87 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  52.21 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  52.67 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  53.85 
 
 		 270 aa  244  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  53.85 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  52.23 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  52.02 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  51.82 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  53.23 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  52.63 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  50 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  51.95 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  52.23 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  53.44 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  48.46 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  51.37 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  51.38 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  45.45 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  43.04 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  41.31 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  38.15 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  40.41 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  40.08 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  38.49 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  38.49 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  39.06 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  41.6 
 
 		 245 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  41.6 
 
 		 245 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  40.77 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  40.77 
 
 		 312 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  38.22 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  40.38 
 
 		 312 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  40.35 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  36.74 
 
 		 304 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  37.8 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  39.62 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  39.18 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  39.22 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  37.88 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  39.13 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  38.82 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  37.89 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  37.31 
 
 		 300 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  37.93 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  38.33 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  35.8 
 
 		 297 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  38.7 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  38.49 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  35.12 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  34.24 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  34.24 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  34.24 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  34.63 
 
 		 244 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  36.51 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  38.14 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  37.8 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  31.93 
 
 		 290 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.62 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  32.64 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  35.96 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  35.57 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  29.9 
 
 		 286 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  29.88 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  37.55 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  36.29 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  31.05 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  29.34 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  32.26 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  30.34 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  32.52 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  33.19 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  29.85 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  30.2 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  31.22 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  33.04 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.89 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  28.51 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  30.35 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  30.62 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  28.46 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  31.47 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  32.27 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  32.27 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  32.27 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  32.27 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  32.27 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  29.75 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  30.65 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  30.65 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  30.65 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  30.65 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>