119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49400 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49400  predicted protein  100 
 
 
334 aa  672    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.396172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  53.85 
 
 
248 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86026  ZIP family transporter: zinc ion  39.57 
 
 
554 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  36.89 
 
 
267 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  36.89 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  35.54 
 
 
265 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  35.1 
 
 
265 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  32.86 
 
 
310 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  34.86 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  32.39 
 
 
279 aa  92.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  32.07 
 
 
261 aa  85.9  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  33.6 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  33.6 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  29.8 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  31.47 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  33.66 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.29 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  28.22 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  28.12 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  30.08 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  31.05 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  27.92 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  28.52 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  31.22 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.21 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  31.72 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  31.72 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  28.33 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  32.09 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  25.81 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.43 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  30.04 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  29.2 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  29.24 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  31.25 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  31.05 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  31.25 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  30.18 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  31.05 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.49 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  29.81 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  24.36 
 
 
272 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  29.41 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  26.72 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  28.69 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  28.02 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  30.5 
 
 
276 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  28.19 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  28.03 
 
 
258 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  29.34 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  26.18 
 
 
266 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  29.34 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  30.22 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  26.77 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.55 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  26.07 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  31.53 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  32.65 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  28.93 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.1 
 
 
262 aa  59.7  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  28.95 
 
 
264 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  26.82 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  27.86 
 
 
273 aa  59.7  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  35.77 
 
 
285 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  32.14 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  28.51 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  30.33 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  34.38 
 
 
125 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  28.39 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  29.44 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  28.4 
 
 
277 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  28.06 
 
 
297 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  29.75 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  29.75 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  30.05 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  28.99 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  28.92 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  30.16 
 
 
239 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  32.5 
 
 
270 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  25.38 
 
 
281 aa  53.5  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  32.08 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  28.89 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  26.81 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  29.17 
 
 
246 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  30.77 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  31.05 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  28.89 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  32.65 
 
 
253 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.03 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  27.37 
 
 
232 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  28.02 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  31.97 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  35.42 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  35.87 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  35.87 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  35.87 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  35.87 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  35.87 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  35.87 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>