160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6528 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  100 
 
 
125 aa  243  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  44 
 
 
271 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  43.2 
 
 
269 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  43.2 
 
 
268 aa  88.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  40.8 
 
 
275 aa  87  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  41.73 
 
 
277 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  39.83 
 
 
269 aa  86.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  40 
 
 
265 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  40.16 
 
 
298 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  40.65 
 
 
272 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  43.2 
 
 
266 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  38.4 
 
 
281 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  39.06 
 
 
298 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  37.21 
 
 
298 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  44 
 
 
266 aa  83.6  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  39.06 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  40 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  44 
 
 
267 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  39.83 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  40 
 
 
279 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  36.8 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  36.8 
 
 
390 aa  77.4  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  41.6 
 
 
232 aa  77.4  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  51.16 
 
 
247 aa  77.8  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  36 
 
 
265 aa  77.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  37.8 
 
 
289 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  39.2 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  41.27 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  41.27 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  38.4 
 
 
255 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  42.4 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  35.66 
 
 
247 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  41.6 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  41.6 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  41.6 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  41.6 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  41.6 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  42.4 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  40 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  40.8 
 
 
257 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  39.29 
 
 
262 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  34.4 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  34.11 
 
 
265 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  36.51 
 
 
304 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  35.88 
 
 
267 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  33.59 
 
 
267 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  33.33 
 
 
265 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  35.2 
 
 
239 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  39.2 
 
 
252 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01521  zinc transporter ZupT  52.83 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  33.6 
 
 
239 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  33.08 
 
 
273 aa  60.8  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  35.59 
 
 
261 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  42.05 
 
 
279 aa  60.1  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  33.59 
 
 
254 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  35.71 
 
 
309 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  32 
 
 
255 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.1 
 
 
264 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  38.28 
 
 
300 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  45.95 
 
 
246 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  32.52 
 
 
244 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49400  predicted protein  34.38 
 
 
334 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.396172  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86026  ZIP family transporter: zinc ion  32.28 
 
 
554 aa  57.4  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  36.51 
 
 
244 aa  57.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  43.1 
 
 
248 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  44.16 
 
 
255 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  32.56 
 
 
271 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  34.17 
 
 
258 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.2 
 
 
244 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  47.56 
 
 
300 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  35 
 
 
246 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  35.4 
 
 
235 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  35.16 
 
 
271 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  33.87 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  29.46 
 
 
271 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  31.01 
 
 
271 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  33.08 
 
 
268 aa  53.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  31.78 
 
 
310 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  34.07 
 
 
270 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  34.88 
 
 
272 aa  52  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  36.03 
 
 
270 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4420  zinc/iron permease  42.42 
 
 
409 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  33.87 
 
 
261 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  32.82 
 
 
260 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  32.82 
 
 
260 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  31.06 
 
 
271 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.56 
 
 
259 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  33.58 
 
 
272 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  32.8 
 
 
245 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  32.8 
 
 
245 aa  50.1  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  35.54 
 
 
305 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  32.54 
 
 
258 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>