161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0856 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  100 
 
 
289 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  66.11 
 
 
298 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  67.01 
 
 
298 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  64.57 
 
 
298 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  67.33 
 
 
300 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  60.84 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  56.79 
 
 
277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  49.31 
 
 
272 aa  288  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  51.93 
 
 
268 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  50.35 
 
 
281 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  52.08 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  49.26 
 
 
266 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  49.64 
 
 
266 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  49.26 
 
 
267 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  48.47 
 
 
291 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  47.97 
 
 
291 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  45.64 
 
 
270 aa  235  7e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  46.95 
 
 
265 aa  225  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  42.36 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  44.98 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  44.1 
 
 
265 aa  191  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  43.69 
 
 
269 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  40.36 
 
 
258 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  41.03 
 
 
280 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  47.94 
 
 
390 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  37.45 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  39.04 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  35.93 
 
 
255 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  54.55 
 
 
188 aa  142  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  36.27 
 
 
253 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  34.39 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  34.36 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  34.26 
 
 
257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  34.26 
 
 
257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  34.26 
 
 
257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  34.26 
 
 
257 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  36.49 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  31.79 
 
 
232 aa  113  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  28.82 
 
 
272 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  32.63 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  34.04 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  28.82 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  31.01 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  30.07 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  32.48 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.55 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  30.63 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  26.87 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  31.97 
 
 
264 aa  87  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01521  zinc transporter ZupT  58.9 
 
 
77 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  29.78 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  31.03 
 
 
261 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  28.28 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  30.04 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.48 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.22 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  29.93 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  28.21 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  28.35 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  29.14 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  28.89 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.91 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  28.46 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  29.04 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.43 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.43 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.24 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  28.47 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  29.02 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  38.58 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  27.52 
 
 
239 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28.99 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  31.89 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  30.43 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  30.43 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.81 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.62 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  28.52 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65571  vacuolar Zn-iron permease  42 
 
 
499 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.870397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  29.23 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  31.52 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.57 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  27.74 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  30.93 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  28.27 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.61 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  27.99 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  27.54 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  28.2 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  30.22 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  28.84 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  29.21 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>