85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4420 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4420  zinc/iron permease  100 
 
 
409 aa  795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2573  putative metal cation transporter  48.91 
 
 
416 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4007  putative metal cation transporter  38.61 
 
 
416 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1662  putative metal cation transporter  36.17 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1130  putative metal cation transporter  37.96 
 
 
392 aa  236  7e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.318417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0084  putative metal cation transporter  42.03 
 
 
394 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2512  putative metal cation transporter  39.8 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0162698  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3970  putative metal cation transporter  39.78 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.750927 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4421  putative metal cation transporter  37.87 
 
 
403 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0303  zinc transporter  32.39 
 
 
321 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2268  putative metal cation transporter  30.59 
 
 
301 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5000  putative metal cation transporter  36.63 
 
 
280 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0605  zinc/iron permease  36.36 
 
 
276 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.073996  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2368  zinc/iron permease  45.7 
 
 
294 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1983  ZIP family zinc transporter  35.29 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.731649  normal  0.881196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0814  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  26.1 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  27.39 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1350  ZIP family zinc transporter  33.18 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234578 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  27.57 
 
 
277 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  27.51 
 
 
268 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25.66 
 
 
261 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  29.45 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25.83 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  32.45 
 
 
258 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1201  ZIP family zinc transporter  32.26 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0954273  normal  0.723044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  28.11 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0974  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22438 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  30.99 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  24.6 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  32 
 
 
260 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  32 
 
 
260 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  25.2 
 
 
281 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  31.86 
 
 
317 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29.63 
 
 
247 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  28.06 
 
 
246 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  30.89 
 
 
247 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  28.93 
 
 
265 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  25.82 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  30.2 
 
 
252 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  25.84 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  31.51 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  30.24 
 
 
308 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  42.42 
 
 
125 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  33.12 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  31.08 
 
 
312 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  24.11 
 
 
266 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  30.24 
 
 
305 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  31.33 
 
 
300 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  31.08 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.27 
 
 
255 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.83 
 
 
239 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  31.47 
 
 
312 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  31.45 
 
 
250 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  26.49 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  29.63 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  30.57 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  35.65 
 
 
239 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  30 
 
 
279 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  32.48 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  26.64 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.73 
 
 
251 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.88 
 
 
271 aa  46.6  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.75 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  27.84 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  30.77 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.57 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  32.89 
 
 
254 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  26.12 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  29.52 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  27.54 
 
 
271 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  29.88 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01521  zinc transporter ZupT  36.78 
 
 
77 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  26.56 
 
 
232 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  28.57 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  27.63 
 
 
258 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  34.65 
 
 
273 aa  43.9  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  25.75 
 
 
269 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  24.59 
 
 
272 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  28.57 
 
 
271 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  32.41 
 
 
270 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  27.76 
 
 
273 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  30.46 
 
 
269 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  26.59 
 
 
257 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  35.53 
 
 
262 aa  43.1  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>