40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1130 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1662  putative metal cation transporter  82.65 
 
 
392 aa  671    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1130  putative metal cation transporter  100 
 
 
392 aa  771    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.318417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0084  putative metal cation transporter  42.01 
 
 
394 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204123  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4420  zinc/iron permease  37.96 
 
 
409 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2512  putative metal cation transporter  36.75 
 
 
402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0162698  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4007  putative metal cation transporter  36.29 
 
 
416 aa  212  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2573  putative metal cation transporter  38.38 
 
 
416 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3970  putative metal cation transporter  36.39 
 
 
403 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.750927 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4421  putative metal cation transporter  35.52 
 
 
403 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0303  zinc transporter  34.3 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2268  putative metal cation transporter  34.26 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2368  zinc/iron permease  42.75 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1983  ZIP family zinc transporter  30.54 
 
 
279 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.731649  normal  0.881196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0605  zinc/iron permease  32.91 
 
 
276 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.073996  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0974  hypothetical protein  30.22 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5000  putative metal cation transporter  40.44 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1350  ZIP family zinc transporter  30.3 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1201  ZIP family zinc transporter  35.33 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0954273  normal  0.723044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0814  conserved hypothetical protein  34.16 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  31.45 
 
 
246 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  30.22 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.32 
 
 
247 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  26.8 
 
 
271 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  26.49 
 
 
268 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.4 
 
 
247 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  27.23 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  29.34 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  30.92 
 
 
270 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.79 
 
 
255 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  28.87 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  30.07 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.1 
 
 
239 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  26.54 
 
 
265 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  29.41 
 
 
239 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  31.68 
 
 
255 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  45.45 
 
 
239 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  28.08 
 
 
252 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  28.86 
 
 
269 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  41.38 
 
 
125 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  33.08 
 
 
297 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>