41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1662 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1662  putative metal cation transporter  100 
 
 
392 aa  773    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1130  putative metal cation transporter  82.65 
 
 
392 aa  671    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.318417 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4420  zinc/iron permease  36.17 
 
 
409 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0084  putative metal cation transporter  39.22 
 
 
394 aa  222  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2512  putative metal cation transporter  35.9 
 
 
402 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0162698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2573  putative metal cation transporter  35.14 
 
 
416 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4007  putative metal cation transporter  36.34 
 
 
416 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3970  putative metal cation transporter  35.6 
 
 
403 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.750927 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4421  putative metal cation transporter  36.62 
 
 
403 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0303  zinc transporter  33.47 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2268  putative metal cation transporter  32.27 
 
 
301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2368  zinc/iron permease  43.07 
 
 
294 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0605  zinc/iron permease  31.68 
 
 
276 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.073996  normal  0.0988695 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1983  ZIP family zinc transporter  30.05 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.731649  normal  0.881196 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0974  hypothetical protein  32.86 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5000  putative metal cation transporter  37.42 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1350  ZIP family zinc transporter  32.32 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1201  ZIP family zinc transporter  32.47 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0954273  normal  0.723044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0814  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  29.47 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  35.25 
 
 
246 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  28.4 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  26.95 
 
 
280 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  28.03 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.05 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  27.66 
 
 
255 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  33.1 
 
 
261 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.77 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  39.24 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.97 
 
 
239 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  25.91 
 
 
305 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25.64 
 
 
247 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  36 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.85 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  28.68 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  28.47 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  28.12 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  28.1 
 
 
258 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  34.21 
 
 
188 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.59 
 
 
269 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  28.83 
 
 
265 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>