98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01521 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01521  zinc transporter ZupT  100 
 
 
77 aa  155  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  82.54 
 
 
269 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  58.9 
 
 
289 aa  87.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  63.93 
 
 
265 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  52.7 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  62.5 
 
 
298 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  51.35 
 
 
298 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  56.45 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  60 
 
 
265 aa  78.2  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  52.78 
 
 
277 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  49.23 
 
 
268 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  58.46 
 
 
280 aa  77  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  64.29 
 
 
271 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  48.68 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  60.66 
 
 
390 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  50.82 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  49.35 
 
 
267 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  50.75 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  46.67 
 
 
275 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  57.35 
 
 
300 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  50.79 
 
 
266 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  53.57 
 
 
281 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  66.67 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  47.62 
 
 
258 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  64.29 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  47.76 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  47.76 
 
 
291 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  48.21 
 
 
255 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  40 
 
 
257 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  51.61 
 
 
279 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  52.83 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
257 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  46.43 
 
 
253 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  47.54 
 
 
252 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  42.31 
 
 
232 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  42.86 
 
 
246 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  40.62 
 
 
239 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65571  vacuolar Zn-iron permease  35.85 
 
 
499 aa  53.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.870397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  50 
 
 
254 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  43.08 
 
 
247 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  39.06 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  47.54 
 
 
261 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  36.67 
 
 
244 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  46.67 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  46.3 
 
 
239 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  51.79 
 
 
305 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  46 
 
 
248 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  40.74 
 
 
247 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  40.74 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  42.59 
 
 
239 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  47.46 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  47.46 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19330  predicted divalent heavy-metal cations transporter  36.21 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  35.19 
 
 
255 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  45.65 
 
 
261 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  35.82 
 
 
258 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4420  zinc/iron permease  36.78 
 
 
409 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  50.88 
 
 
290 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  45.9 
 
 
259 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  46.38 
 
 
258 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  45.71 
 
 
308 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  46.3 
 
 
273 aa  42.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  43.64 
 
 
304 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  42.11 
 
 
279 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  40.91 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  47.62 
 
 
235 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  31.58 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  45.71 
 
 
305 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  47.06 
 
 
317 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  44.62 
 
 
309 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  36.36 
 
 
273 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  43.94 
 
 
309 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  42.86 
 
 
245 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  37.66 
 
 
271 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  42.86 
 
 
245 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  50 
 
 
312 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0543  zinc/iron permease  39.06 
 
 
240 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.884027  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  48.21 
 
 
312 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  37.84 
 
 
277 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  48.21 
 
 
312 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  51.06 
 
 
285 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  43.1 
 
 
271 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  40 
 
 
269 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  35.62 
 
 
271 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  48.21 
 
 
250 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  32.18 
 
 
267 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>