95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19330  predicted divalent heavy-metal cations transporter  100 
 
 
242 aa  464  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  27.49 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  28.76 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  29.21 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  25.97 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  26.34 
 
 
264 aa  62.4  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  26.1 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  31.82 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  27.54 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  25.77 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  28.02 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  25.88 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  24.79 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.96 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  27.16 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25.1 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  25.83 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  25.43 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.62 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.83 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  26.71 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  26.02 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  26.63 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  27.23 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.32 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  28.77 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  25.71 
 
 
269 aa  52  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  28.12 
 
 
298 aa  52  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  30.37 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  28.51 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.14 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.14 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  24.06 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  24.08 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  24.17 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  24.17 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  24.17 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  24.17 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  24.17 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  27.62 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  27.89 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  27.43 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  23.4 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  30.43 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  26.92 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  26.32 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  26.09 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  27.91 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  27.48 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  27.22 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  26.61 
 
 
254 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  24.71 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.7 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  26.82 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  26.59 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.16 
 
 
309 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  26.57 
 
 
390 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  26.59 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  26.54 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  23.86 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01521  zinc transporter ZupT  36.21 
 
 
77 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  30.43 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.58 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  22.58 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  27.98 
 
 
289 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  23.26 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  24.39 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  28.12 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  26.63 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  32 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  29.66 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  25.62 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  25.38 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  26.17 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  24.66 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2268  putative metal cation transporter  35.06 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  28.09 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  28.9 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  25.32 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  32.93 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  28.33 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2427  zinc transporter family protein  29.9 
 
 
245 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0279289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2231  zinc transporter family protein  29.25 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2395  zinc transporter family protein  29.25 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  25.73 
 
 
273 aa  42  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>