198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0057 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  100 
 
 
235 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  44.14 
 
 
239 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  40.27 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  39.81 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  38.16 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  41.1 
 
 
237 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  34.97 
 
 
247 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  34.89 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  30.74 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  37.39 
 
 
255 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  31.68 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  33.19 
 
 
267 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  36.32 
 
 
279 aa  91.7  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  33.18 
 
 
258 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  32.2 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  31.79 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  32.29 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  33.78 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  35.45 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  30.3 
 
 
268 aa  86.3  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  32.89 
 
 
266 aa  85.5  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  33.33 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  33.62 
 
 
261 aa  85.1  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  35.59 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  30.83 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  28.68 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  36.24 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  36.24 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  27.8 
 
 
277 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  32.65 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  33.96 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  33.18 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2098  zinc/iron permease  50 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  33.18 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  31.2 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  33.81 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  31.44 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.2 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  33.81 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  31.84 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  33.01 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  31.8 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  31.58 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  34.08 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  30.84 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  33.93 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  30.93 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  34.27 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  32.74 
 
 
309 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  34.08 
 
 
312 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  34.74 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  33.93 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  30.82 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  33.18 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  32.86 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  28.74 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  34.4 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  31.75 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  25.37 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  30.36 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  31.65 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  26.28 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  38.62 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  29.86 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  31.05 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  29.82 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  30.21 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  26.55 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  30.49 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  31.9 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  38.53 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  30.45 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  30.45 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2361  zinc transporter family protein  30.11 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  34.42 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1768  zinc/iron permease  25.15 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.556634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  32.57 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2970  zinc transporter family protein  28.11 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.137071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  31.28 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  26.45 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  27.4 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  28.7 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  33.95 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  31.08 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  31.12 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  34.26 
 
 
297 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>