157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0707 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  100 
 
 
251 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  46.95 
 
 
263 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  47.89 
 
 
268 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  48.36 
 
 
305 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  45.42 
 
 
291 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  46.36 
 
 
268 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  46.36 
 
 
268 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  42.92 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  39.92 
 
 
265 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  42.45 
 
 
258 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  45.98 
 
 
289 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  45.31 
 
 
257 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  45.1 
 
 
257 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  35.29 
 
 
271 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  37.22 
 
 
229 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  43.13 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  33.21 
 
 
298 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  35.11 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  35.38 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  34.05 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  31.34 
 
 
316 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  34.34 
 
 
276 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  34.34 
 
 
276 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  33.02 
 
 
231 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  39.39 
 
 
301 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  30 
 
 
246 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  37.29 
 
 
242 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  35.18 
 
 
244 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  36.36 
 
 
391 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  30.63 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  34.45 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.96 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  32.11 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  30.96 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  40 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.98 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  27.01 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  32.08 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  30.3 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  30.3 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  30.3 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  30.3 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  30.3 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.24 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  30.77 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.74 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  28.66 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  32.64 
 
 
477 aa  65.1  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  32.64 
 
 
477 aa  65.1  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  31.3 
 
 
472 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  25.59 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  26.21 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.39 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25.82 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  25.37 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.91 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  26.55 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  24.26 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.91 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  25 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  25 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  25 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.91 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  27.75 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  23.76 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  25.11 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.03 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  26.46 
 
 
305 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  23.67 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  24.07 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  24.88 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.85 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  27.05 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  25.93 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  23.97 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  23.32 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  24.26 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  25.78 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  28.57 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.9 
 
 
298 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  25.11 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  25.44 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  28.64 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  21.93 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  24.34 
 
 
269 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  25.65 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.75 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  22.71 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  25.49 
 
 
309 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  42.86 
 
 
336 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  42.86 
 
 
335 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  25.59 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  24.67 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>