91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1549 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  100 
 
 		 301 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  66.22 
 
 		 298 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  65.99 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  67.03 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  67.03 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  66.19 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  69.09 
 
 		 276 aa  268  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  68.73 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  56.15 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  41.88 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  42.34 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  45.32 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  35.88 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  35.5 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  41.22 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  41.58 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  39.39 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  35.71 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.23 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  41.26 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  41.44 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  39.54 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  40.6 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  33.48 
 
 		 229 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  31.17 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  30.2 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  31.52 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  27.1 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  26.42 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  38.83 
 
 		 115 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  24.84 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  26.29 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  25.79 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  27.08 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  24.89 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25.87 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  25.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  26.01 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  26.01 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  26.01 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  26.01 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.65 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  24.86 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  25.43 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  23.01 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.42 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  26.7 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  29.63 
 
 		 388 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  25.71 
 
 		 391 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  24.51 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  24.51 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.68 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  24.37 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.32 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29694  ZIP family transporter: zinc ion  25 
 
 		 477 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0036517 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25431  ZIP family transporter: zinc ion  25 
 
 		 477 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  26.76 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  22.13 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  22.17 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  21.26 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  24.11 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  21.23 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  24.84 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  19.72 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  24.84 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  24.84 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  25.17 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  28.21 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  44.64 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  28.37 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  44.64 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  24.2 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  22.88 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  25.81 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  26.57 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  22.82 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  24.84 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  24.24 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  28.32 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  24.63 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  24.79 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>