82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1484 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  100 
 
 		 271 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  77.21 
 
 		 275 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  65.31 
 
 		 316 aa  315  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  62.37 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  65.95 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  66.43 
 
 		 276 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  65.71 
 
 		 276 aa  260  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  66.18 
 
 		 301 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  55.93 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  46.49 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  42.97 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  38.2 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  36.23 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  41.57 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  43.18 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  42.32 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  41.2 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  36.26 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  37.74 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.46 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  40.68 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  41.35 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  39.47 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  34.07 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  29.96 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  30.94 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  29.09 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  29.41 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  29.63 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  25.08 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  42.27 
 
 		 115 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  25.08 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  27.4 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  27.54 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  28.97 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  21.76 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  24.06 
 
 		 266 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  30.3 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  22.69 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  23.58 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  27.87 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0974  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  25.45 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  23.53 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  21.74 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  26 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  24.54 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  23.87 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  24.54 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  26.77 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  24.06 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  30.95 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  25.54 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  25.54 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  25.54 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  25.54 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  25.54 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  21.55 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  42.86 
 
 		 335 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  24.46 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  42.86 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  23.65 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  22.73 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  23.18 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  23.65 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  23.65 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  24.69 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  26.7 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  21.79 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  24 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  27.66 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06216  ZIP metal ion transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12050)  26.63 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.369537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  25 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  25 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.42 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  24.51 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.3 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  23.81 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  23.81 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  26.67 
 
 		 239 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>