83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1804 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  100 
 
 		 260 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  52.76 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  55.56 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  47.28 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  52.54 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  50.9 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  48.72 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  48.35 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  55 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  43.62 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  35.11 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  39.3 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  36.43 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  38.11 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  37.74 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  36.12 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  39.48 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  39.5 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  35.06 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  31.02 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  33.47 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  36.8 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  31.08 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  30.36 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  30.71 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  28.7 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  29.21 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  28.93 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  30.67 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  30.82 
 
 		 373 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  27.27 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1529  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.11 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  26.6 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  24.67 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  26.67 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  26.67 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  26.67 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  26.67 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  28.12 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  25.64 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.02 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  29.81 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  38.71 
 
 		 115 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89316  ZIP family transporter: zinc ion  26.67 
 
 		 472 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.68931  normal  0.0947309 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  23.71 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  23.9 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  27.98 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  27.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  23.94 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  20.67 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  24.88 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  27.15 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  22.75 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  26.21 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.5 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  32.58 
 
 		 388 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  21.88 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25.75 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  22.86 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25.75 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  23.44 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  23.44 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25.73 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  22.31 
 
 		 391 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  25.13 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  22.87 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  20.98 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  25.9 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  25.49 
 
 		 251 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  25.9 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>