163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2227 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  94.03 
 
 		 268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  92.91 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  74.43 
 
 		 305 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  72.83 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  65.23 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  66.02 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  48.46 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  56.82 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  47.04 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  42.16 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  44.14 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  42.16 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  47.83 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  41.54 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  39.83 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  37.41 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  36.82 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  42.86 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  36.07 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  38.57 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  38.21 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  34.6 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  41.13 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  34.8 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  32.57 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  36.44 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  29.49 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  42.72 
 
 		 115 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  35.4 
 
 		 373 aa  85.9  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  23.05 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  30.16 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.51 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  28.85 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  27.81 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  24.89 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.49 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.13 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.63 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.78 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  27.12 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.3 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.34 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  25.97 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  24.46 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  26.01 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  31.79 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  27.59 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  27.04 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  28.82 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  26.41 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  27.41 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  24 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  25.82 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.63 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  27.46 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  26.89 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  27.48 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  27.48 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  39.08 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  27.48 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  27.48 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  28.17 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25.85 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.17 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  26.34 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  39.08 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  25.71 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  25.89 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  25.89 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  21.9 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  27.1 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  26.91 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  23.76 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  23.76 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  23.53 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.37 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.05 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  26.73 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.23 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  29.27 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  21.68 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  26.51 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  23.85 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  22.94 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  25.82 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  29.85 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  26.51 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  25.45 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>