165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2432 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2432  zinc/iron permease  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2039  zinc/iron permease  98.88 
 
 		 268 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2227  hypothetical protein  94.03 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2621  zinc/iron permease  73.41 
 
 		 291 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929166  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0876  Zinc transporter ZIP  72.22 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1427  zinc/iron permease  65.23 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.860799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1709  zinc/iron permease  66.41 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3004  putative transmembrane protein  56.65 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0148799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1606  Zinc transporter ZIP  47.83 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  46.92 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1978  Zinc transporter ZIP  42.47 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1597  zinc/iron permease  42.86 
 
 		 258 aa  205  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000207833  unclonable  0.000000194767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1484  zinc/iron permease  40.94 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.671333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1765  ZIP Zinc transporter  47.01 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2494  zinc/iron permease  40.15 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2879  zinc/iron permease  37.41 
 
 		 298 aa  171  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360205  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1960  zinc/iron permease  40 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1944  zinc/iron permease  36.82 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552942  hitchhiker  0.00979273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1734  zinc/iron permease  41.79 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5323  zinc/iron permease  36.43 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.935172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1804  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3315  zinc/iron permease  37.86 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123454  normal  0.0939211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2667  zinc/iron permease  37.5 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1549  zinc/iron permease  37.95 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1419  zinc/iron permease  34.76 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4980  zinc/iron permease  36.89 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.890233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3460  zinc/iron permease  32.31 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1472  zinc/iron permease  30.13 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0975  ZIP zinc transporter domain-containing protein  44.66 
 
 		 115 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48518  predicted protein  31.16 
 
 		 373 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07673  ZIP Zinc transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_2G01460)  22.19 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3911  zinc/iron permease  28.74 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  29.27 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42479  predicted protein  28.72 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  24.49 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  25.32 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3196  zinc/iron transporter  28.21 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000422883  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  26.63 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  25 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.46 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06010  hypothetical protein  38.37 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  24.41 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  26.95 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.27 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  26.84 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  23.44 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  25.59 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  27.86 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  27.86 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  27.86 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  27.86 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  26.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  27.86 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  25.69 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  25.11 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  22.91 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42755  predicted protein  31.79 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.010637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  26.42 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  22.27 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  29.37 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  28.24 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  27.62 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  28 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  23.53 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  25.59 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  24.51 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  22.37 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18031  ZIP family transporter: zinc ion  27.15 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.265806  normal  0.0301114 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27457  ZIP family transporter: zinc ion  37.21 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000202119 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  24.1 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  23.53 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  25 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  23.08 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  26.27 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  28.33 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  26.44 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  25 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  27.42 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  27.16 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  28.74 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  23.27 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  23.38 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  23.27 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  30.6 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  26.51 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  21.4 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  26.51 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  23.59 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>